蛤，蜗牛，龙虾，螃蟹和虾最终存活下来，成了海洋食肉动物的口中食，人类的盘中餐，这次灾难中绝灭的还有蛇颈龙等海洋爬行动物，有翼龙等会飞的爬行动物，有彩蜥等恐龙的陆生爬行动物亲戚，有菊石、箭石等海洋无脊椎动物。
至于海洋中的微型浮游动、植物，钙质浮游有孔虫和钙质微型浮游植物也几乎被一扫而光。经过这场大劫难，当时地球上大约50%的生物属和几乎75%的生物种，从地球上永远地消失了。
陨石撞击还引发气候剧变，地层中发现了高浓度的铱，其含量超过正常含量几十甚至数百倍，而剩下的恐龙们吃了含铱物质的植物，造成慢性中毒，从而蛋里也含有铱，恐龙因食物匮乏，加上吃了含铱食物而中毒，导致灭顶之灾，恐龙统治地球的时代宣告结束。
经过漫长的修复期，到4900万年前的始新世时期，地球渐渐恢复了元气，森林重新繁茂，森林里已经繁衍出许多珍禽异兽，有鳞爬行类的统治一去不复返，哺乳类适应新世界的速度很快，种类也迅速增多，但体形依然较小，受制于大型危险动物如戈氏鸟。戈氏鸟是恐鸟的后代，高度和成年男子一样，体重达到甚至超过半吨，其庞大的体形取代了恐龙，统治着陨石撞击后的地球，这是史上惟一一次鸟类统治地球。
那是一个鸟吃马的奇妙世界，现代马的祖先名为远古马，体态娇小，比猫略大，还没有发展出蹄，脚上只有四个像蹄的趾头。由于身体玲珑，防御能力较弱，远古马的胆子非常小，稍有动静就向密林深处逃跑，它们一旦被戈氏鸟强壮有力的喙噙住，就会被悬在半空中，在无数次大幅度左右甩动中晕倒或者死去，最后成为鸟食。远古马非常喜欢吃发酵的野葡萄，饱食后感官变得迟钝，更增加了送命的几率。
霸主戈氏鸟并非处处得意，由于身材的限制，??们只能在树下做窝、孵蛋，在其外出捕猎的时候，如果小戈氏鸟破壳而出，那势必不能活着跟它的父母见面，这是一个奇妙的链条：最庞大动物的天敌，竟是最渺小的动物。戈氏鸟幼鸟的天敌是蚂蚁，确切地说是蚂蚁的一种——食肉蚁，史上最大的蚂蚁之一，食肉蚁成群围攻小戈氏鸟无毛的身体，喝干它的鲜血。
哺乳动物的飞速壮大证明，哺乳类从来没有放弃过寻求发展的机会，鸟类统治世界的时候，它们就已经开始了水下生活，有的蹄肉食动物演化成游泳高手的过程十分奇妙，松开脊骨、缩小四肢、尾巴改变形状直至更适合游泳。
在鸟类势力不及的水下，哺乳动物长得非常大，并形成新的物种，现代鲸鱼就是这样发展来的，它们的始祖游走鲸，就是一种水陆两栖的大型动物，游走鲸的先祖是纯粹的陆生动物，而它们在水中行动更加灵活。
森林中的陆生哺乳动物也不示弱，早在3000～4000万年前开始出现的，并且在出现之后开始四处生长，当时受南极大陆影响，全球雨林大面积缩小，其他生态形势逐渐增多，许多哺乳动物选择在森林之外生存，成批迁往平原，进入飞跃发展阶段。
海洋区中间变成盆地（或蜀中湖泊），盆地四周山地继续隆起，同时产生不少大断层，如西部的龙门山大断层和东部的华莹山大断层，把盆地分为三部分。封闭的盆地地形及急剧缩小的水面，使气候逐渐变得干热，沉积物由海相、海陆交替相变为陆相，大量风化、侵蚀、剥蚀的物质在盆地堆积了数千米厚，形成红色和紫红色的砂、泥、页岩，在2000多万年前的新第三纪，受喜马拉雅造山运动的影响，裸子植物不断衰退。
距今二、三百万年的第四纪，地壳再次发生构造运动，巫山两侧水系溯源侵蚀，共同切穿巫山，形成举世闻名的长江三峡，盆地之水纳入长江水系，四川盆地从此由内流盆地变为外流陆盆，第四纪是冰川广布的时代，盆地西北山地发育大量冰川，冰川消融后，大量沉积物由岷江、沱江等携带，堆积在西部的凹陷区，即以前的蜀湖之中，最终形成了成都平原。
气候开始变得干燥，大陆的中心变成平原，草原越来越广阔，丛林面积减小。后来，迁居的哺乳动物在平原上猎捕小动物，身材与日俱增，并且开始奔跑，最主要的是，它们中的一部分逐渐变成食草动物，但仅仅吃草很难生存，于是哺乳动物的演化更增进一步：有些物种开始长出不同用途的牙齿，腿开始增长，得以迁徙到遥远的草原，巨犀就是这样发展起来的，我们人类还够不到它们的腿，相对应的，猎食动物也分化出来了，比如猫科动物，现在体积最大的老虎跟其祖先相比，也只相当于一只猫，剑齿虎就是史上最大的猫科动物，它们著名的长齿足有20公分。
100万年前，剑齿虎的种群生活改变了大自然的生态环境，它们从北美洲来到南美洲，统治着南美草原。当时的恐鸟不再占有优势，沦为吃剑齿虎残剩猎物的地位，直到现代人出现之前，恐鸟才灭绝，而剑齿虎一直活到100万年前，活到世界再次发生剧变，气候越来越干冷，它们要猎取的大型动物都消失，缺乏食物才灭绝。
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