陆万龄和曹代并没有气馁，而是又写了一封请求信给了同为司业的朱之俊，朱之俊虽然也觉得此举十分荒唐，魏忠贤何德何能可以跟孔圣人并尊？但他不敢得罪魏忠贤，于是就把尽量敷衍。
而后，天启皇帝西苑落水，这件事情也就拖了下去。
如今东林党人纷纷弹劾魏忠贤，朱之俊知道魏忠贤已经不像天启皇帝时期那样得势，因此也加入了倒魏的大军，弹劾亵渎孔圣人的陆万龄和曹代。
崇祯皇帝万万没有想到国子监的监生竟然要把魏忠贤尊为“圣人”，这可就挑战了他的底线，同时无形中也印证了魏忠贤权势熏天，是“阉党”首领的传言，要不然为何人们都要巴结他，难道其真的是传言中的“九千九百岁”？
对于亵渎孔圣人的行径，崇祯皇帝自然是万分恼火，下令严惩陆万龄和曹代，他可与天启皇帝不一样，对魏忠贤的生祠持反感态度。
国子监的事件后，崇祯皇帝翻阅了不少记载古代帝王权谋之术的书籍，经过一番权衡很快就下定了决心，决定打击魏忠贤以及追随他的“阉党”，重新启用在民间有着良好口碑的东林党。
对于东林党的政治主张崇祯皇帝心中还是非常认同的，既然天启皇帝游刃有余地驾驭群臣，那么他相信自己也能驾驭东林党，在东林党的辅佐下中兴大明。
于是，崇祯皇帝给了东林党一个倒魏的信号，当御史杨维垣疏奏弹劾与魏忠贤关系密切的兵部尚书崔呈秀时，崇祯皇帝随即顺势罢了他的官职。
这立刻在京城官场引发了轰动，就连杨维垣也没有想到崇祯皇帝会如此快地撤了崔呈秀的职务，要知道崔呈秀被东林党视为魏忠贤的左膀右臂，“阉党”的二号人物。
京城里的聪明人很快就从中敏锐地嗅到了异样的气息，崇祯皇帝这是要对魏忠贤以及“阉党”下手了。
于是，东林党人受到了鼓舞，弹劾魏忠贤的奏章雪片般飞到了崇祯皇帝的案桌上，奏章的性质一道比一道狠，除了给魏忠贤扣上了一顶顶的刻有十恶不赦罪名的帽子还说他有谋逆之心，将其比为历史上叛国谋逆的王莽和董卓。
不得不说，论到耍笔杆子和动嘴皮子，魏忠贤在文官面前真的要甘拜下风，自愧不如。
十月底，魏忠贤见京城弹劾他的风气越来越盛，而且崔呈秀等与他关系密切的大员相继被崇祯皇帝罢免官职，他终于意识到崇祯皇帝要拿他来给东林党一个交待，故而进宫向崇祯皇帝哭诉委屈，想要让崇祯皇帝网开一面。
面对痛哭的魏忠贤，崇祯皇帝并没有开口安慰，而是把国子监里嘉兴贡生钱嘉征的上疏让内侍拿给魏忠贤看。
当魏忠贤翻开奏疏后脸色刷一下变得苍白，钱嘉征在上面弹劾了魏忠贤十大罪状，即并帝、蔑后、弄兵、无君、克剥、无圣、滥爵、滥冒武功、建生祠和通关节。
虽然言简意赅但字字珠玑，杀气腾腾，自从杨涟当年弹劾魏忠贤“二十四大罪”外还从未有人这样抨击他。
魏忠贤立刻明白了崇祯皇帝的意思，于是称病闭门不出，并且上疏请辞天启皇帝时期得到的爵位、诰券和田产。
崇祯皇帝恩准了魏忠贤的请辞，以其身体不好为由免了他司礼监首席秉笔太监的职务，让其到白虎堂给天启皇帝守灵。
司礼监首席秉笔太监出任东厂厂督已经成为了大明不成文的定制，故而魏忠贤失去司礼监首席秉笔太监的职位后，他东厂厂督自然也做不成了。
这样一来，曹化淳得以出任司礼监首席秉笔太监，兼任东厂厂督。
魏忠贤原本以为他失去了官职爵位后崇祯皇帝就会平定朝堂上那些针对他的攻讦，可令他和京城其他官员没想到的是，十一月初，崇祯皇帝贴出告示公布了魏忠贤所犯的种种罪行，让其到凤阳去守祖陵。
不仅如此，与魏忠贤相好、曾经担任天启皇帝奶娘的客氏受到牵连，被贬去了浣衣局受苦，家产没收充公，与魏忠贤之间相隔千里，天各一方。
面对眼前这离奇的一幕曹化淳是束手无策，他万万想不到崇祯皇帝会对魏忠贤下如此重的狠手，更清楚崇祯皇帝自小就颇为自负一旦拿定主意后就决然不会轻易更改。
不过，崇祯皇帝身边的另外一名重要的亲信太监，司礼监秉笔太监徐应元认为应该把魏忠贤落在京城，魏忠贤对付朝堂上的官员还是非常有一手。
而且魏忠贤这些年鞍前马后地伺候天启皇帝，没有功劳也有苦劳，希望天启皇帝能够网开一面。
谁成想，徐应元不仅没能帮了魏忠贤反而犯了崇祯皇帝的忌讳，他没想到自己身边的人竟然会给魏忠贤说话，因此一气之下把徐应元一并赶出了京城，让其到南京任职。
徐应元走的时候曹化淳和王承恩前来送行，他拉着曹化淳的手想要说些什么可嘴角蠕动了一下最终没能说出口，神色黯然地离开。
曹化淳知道，徐应元是在替魏忠贤委屈，魏忠贤所办的那些事情都是奉天启皇帝的诏命行事，这一点儿他们这些宦官是一清二楚，没有天启皇帝点头魏忠贤岂敢指挥朝堂上的崔呈秀等大员做事？
尤为重要的是，魏忠贤是对付朝堂上文官集团的高手，如果他走了的话那么内廷的人很难跟文官集团抗衡，而且对内廷的宦官而言也是一个不小的打击。
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